對這麼有能力還如此忠心的人，朱由檢怎會棄之不用呢？只不過前一陣子自顧不暇，沒來得及辦這事，但在閻應元與張煌言相繼出發後，最迫在眉睫的危機已經有所緩和，他這才秘密下令讓錦衣衛護送王徵來京師，因為接下來還有一件大事，非王徵來辦不可，連徐光啟都不行。
接著，崇禎又問周遇吉道：“周卿，新軍的兵種可曾確定？”。他沒問訓練情況，而是直接問起兵種配置來。
周遇吉忙道：“啟稟聖上，臣與李侍郎已初步商定，準備配置兩成刀盾兵，四成長矛兵，火器兵與弓箭兵各一成，還有一成騎兵”。這是按照太祖朱元璋確定的比例來的，洪武十二年規定：每百人刀牌二十，長槍四十，弓三十，銃十，也就是說，長矛兵佔到了明軍總兵力的百分之四十，而火銃僅佔百分之十。
長矛兵所佔比例之所以如此之高，是為了剋制蒙元騎兵，可以說，明軍就是拿著長矛由南向北將蒙元趕出中原的，創造了農耕民族戰勝遊牧民族的奇蹟。要知道，當時的蒙古騎兵可是跟漢之匈奴騎兵和唐之突厥騎兵大不一樣的，漢朝軍隊的鐵製武器數量大大增加，已經遠超戰國末期，甚至部分農民也用上了鐵製農具。而匈奴發展到西漢時期，他們軍隊的裝備仍然很差，青銅兵器居多，鐵製兵器很少，匈奴騎兵的箭簇甚至是骨質和石質的，跟漢朝騎兵的鐵製箭簇根本無法相比，正因為如此，匈奴才想盡辦法從漢朝走私精鐵，這才是衛青、霍去病大勝匈奴的根本原因，雙方在武器裝備上可謂存在著代差。
而到了唐初，突厥的鍛鐵技藝迅速提升，產量也急驟增加，甚至能對外出口，以至於完全能用鋒利的鐵製武器建立起一支龐大的騎兵部隊，因此，唐軍擊敗突厥要比漢軍擊敗匈奴更加吃力，李靖很大程度上是佔了偷襲的便宜。而元朝則全盤接收了金和南宋的冶鐵技術和產能，蒙古騎兵之所以能橫掃歐亞大陸，除了火器之利以外，精良的鐵製武器也功不可沒。在這種情況下，太祖時期的明軍都能用長矛打敗蒙古騎兵，就很是難能可貴了。
那明軍用的是一種什麼樣的長矛呢？據《太祖實錄》記載，明初長矛的長度為一丈三尺，即約4米多，戚家軍的狼筅達5米，秦良玉的白桿兵用的也是一種特製的長矛，這種長矛用結實的白木做成長杆，上面配有帶刃的鉤，下配堅硬的鐵環，作戰時，鐵鉤可砍可拉，鐵環則能用作錘擊武器，必要時，數十根長矛鉤環相接，可以做成雲梯，當作爬山攀牆的工具，非常適宜于山地作戰。
崇禎聽後點了點頭，但卻是不解的問道：“為何火銃兵的比例只有一成？是不是太少了”。他心想，明初都達到一成了，這都過去兩百多年了，還是一成，這不是等於沒進步嗎？
朱由檢問出這個問題一點毛病沒有，因為早在嘉靖年間，明軍裝備序列中的火器佔比就達到了三成，戚繼光步兵的鳥銃裝備率甚至達到了四成，怎麼到了這裡又下降到了一成，這可是新軍啊！
周遇吉一看皇帝有些不高興，忙起身拱手道：“佔比低是因為大明產的鳥銃射程近、射速慢，難以抵禦建奴的騎兵”。
“難以抵禦建奴的騎兵？這李自成的騎兵總能抵禦吧！更何況，我大明軍隊在嘉靖時期火器裝備率就達到了三成，難道工部造出來的火銃比嘉靖時的火銃射速還近，射速還低？″。
“這……，這……，周遇吉頓時語塞，他不是不知道火器裝備率低的真正原因，但即使是他，也不敢當著這麼多人的面說出來啊，如果他敢這麼做，一定得罪多少人，遭彈劾都是輕的！
“周卿不知道，還是不敢說？”崇禎盯著周遇吉，一臉的嚴肅。
周遇吉此時感到羞愧難當，皇帝對自已有知遇之恩，現在又如此提拔自已，而自已竟然因為怕得罪人辜負了聖上，真是一萬個不應該啊！
想到這裡，周遇吉頓時下定決心，他鼓起勇氣，整理了一下衣冠，準備道出事實真相，可他剛抬起頭想要開囗，崇禎卻擺了擺手打斷了他。
“還是朕來說吧，是不是工部交上來的火銃粗製濫造，質量低劣，容易炸膛，士兵們不願使用，你們只能選稍好一點的用，打個比方，工部給你們一百支火銃，你們只能選出十支能用的，可就算是這十支，大部分還是三眼銃這樣的簡易火銃，是不是？”崇禎一開始還比較平靜，但越說越激動，到最後幾乎是吼了出來，帳中眾人見皇帝發怒了，都慌忙下跪請罪。
這其實早已是公開的秘密了，明末官場的貪汙腐敗已經達到了登峰造極的程度，幾乎是無官不貪，而鑄造火器有著很大的油水，以嘉靖年間傳入的鳥銃為例，一把鳥銃的造價就是四兩白銀，按照明軍一百三十萬人的編制計算，就有十三萬鳥銳兵，人手一支就是五十二萬兩白銀，看上去不多是不是？可不要忘了，這可是消耗品，由於當時的工藝落後，一支鳥銃打上兩三百發鉛彈後，銃管就會報廢，不能使用了，可士兵們平時的訓練需要大量發射銃彈，一個月怎麼也得打上個十幾二十發吧，更別說還要作戰了，因此，基本上一兩年就要更換一次裝備，這可是不小的一筆開銷啊！
於是乎，負責火銃製造的軍器局和兵仗局主事就成了人人眼紅的美差，戶部一撥下銀子來，就肥了他們和他們背後的靠山，材料費不夠？用最便宜的！高品質的鐵料買不起？用帶雜質的貧鐵湊活！人工費太高，簡化工藝，省出來的都是自已的，他們怎能不挖空心思偷工減料呢？
如此造出來的鳥銃，質量可想而知，到了戰場上造成的後果簡直是慘不忍睹，由於銃管中的含硫量嚴重超標，非常容易炸膛，只要多用一點火藥，都要冒著被炸死炸傷的風險，以致於士兵們不敢按標準用量填充藥池，使得火銃的射程和威力更加不足。
面對龍顏大怒的皇帝，帳中諸人一個個跪伏在地上不敢作聲，周遇吉只得將罪責往自已身上攬，他語氣低沉的向崇禎道：“臣有負陛下重託，沒能杜絕軍中的種種亂象，請陛下恕罪？”。在這種情況下，他也只能這麼說了，其實，他的勇衛營在明軍中已經算是好的了，但軍械尤其是火銃這塊，也好不到哪去，這是大明的積弊，不是他能夠改變的。
“罪不在你，你不用替他人攬過，朕一想到我大明的將士沒有死在與建奴流賊搏殺的戰場上，卻死在這粗製濫造，偷工減料的火器上，就氣不打一處來？那幫蛀蟲還是人嗎？豬狗不如！這麼著吧！朕今天把話撂在這，諸位將官也都聽好了，以後再有一支以次充好的劣制火器出現在我大明軍中，是哪個中飽私囊弄的，我要他和他九族的項上人頭，你們可都清楚了？”。
帳中拜伏的眾將連連稱是，崇禎這才讓他們起來，朱由檢之所以要敲打這些人，是因為他知道，他們中間有些人是軍器局和兵仗局主事們的後臺，這是一種警告，如果他們再不長眼，拿不該拿的銀子，他們也跑不了。看著他們如喪考妣的樣子，崇禎一陣心煩，揮手讓他們退下，但周遇吉卻被留了下來。
崇禎指著自已旁邊的一把椅子讓他坐下，皇帝賜坐，周遇吉受寵若驚，但也只是坐了半個屁股，坐直了身子，沒敢倚下去，皇帝面前有的坐就不錯了，他豈敢造次。
崇禎指了指自已身旁的一位老者向周遇吉介紹道：“這位是張燾，錢塘人，曾任登萊副總兵，你們認識一下吧！”。