其實，在清遠門伏擊闖軍的準備工作早就開始了，現在只需分派具體的任務即可，閻應元任命參將朱家仕負責指揮這次伏擊，接到命令的各個將官緊張的忙碌起來。
大同城一共有四個門，分別是東之和陽門、南之永泰門、西之清遠門、北之武定門，四門之中，除清遠門之外都有附城。附城指的是在主城之外另建的一座小城，與主城靠的很近，用來加強城門附近的防禦，也就是說，敵軍必須攻佔附城之後才能接近城門。
雖然西城門沒有附城，卻有甕城，甕城其實就是沿著城門及其附近的主城牆又建一道凸出的輔助城牆，輔助城牆和主城牆圍起來的部分就形成了甕城。甕城之外還有月城，沿著甕城又建一道凸出的城牆就形成了月城，因此，敵軍要攻佔月城和甕城才能接近城門。
在清遠門，甕城、月城，牆外的吊橋、護城河，以及矗立於城牆上的角樓、望樓、箭樓等工事構成了一套非常嚴密的防禦體系。
因此說西城門容易攻取，也只是相對而言的，從另一個角度來說，正因為西城門沒有附城，防禦一方更會刻意加強這裡的兵力，因此，從清遠門攻城的難度其實並不比其它三門低。這在接下來李自成大軍的攻城戰中得到了很好的體現。
不僅如此，就搞伏擊而言，西城門反而比其它三個城門更容易，這是因為附城雖然比甕城大，防禦能力也更強，但卻是相對獨立於主城的，在附城打伏擊不容易得到主城方向的支援，而甕城則是依託主城牆而建的，因而能得到主城的直接支援，也可以形成更嚴密的伏擊圈。
大同城門忙碌一片的同時，闖軍大營也動了起來，點齊人馬，準備開拔。由於情報不充分，存在不確定風險，馬世耀本想將突擊兵力控制在2000人的，但考慮到大同城區太大，代王家丁和衛景暖手下的衙役也會頑強抵抗，闖軍雖然有姜瓖部的支援，但兵力少了恐怕很難迅速控制大同。
更重要的是，只有投入足夠兵力，才能在第一時間控制住金庫、軍械庫、糧倉等重要衙署，這些衙署是由差役而非兵丁把守的，在衛景暖的控制之下，如果被姜瓖搶先佔據，自已再去要，那可就難如登天了，已經吃到嘴裡的肉怎麼可能再吐出來呢？即使姜瓖將來交給陛下，也不是自已的功勞，因此，馬世耀狠狠心，最終決定拿出3000騎兵，少了不保險。
馬世耀本來是想親自帶兵突擊的，但大同城內情況的不透明又讓他非常不安，左思又想之下他還是命自已的親信李雙喜前去，反正李雙喜是自已的部屬，他拿下大同，首功也是自已的，出了問題還可以推到他身上，何樂而不為呢。但李雙喜對此卻非常興奮，因為這相當於給了他一個美差，馬世耀此前已經發話，城中大戶任取，李雙喜完全可以將搶來的財貨先行藏私一部分再上交，這已經是闖軍內部的“潛規則”了，除去“孝敬”馬世耀和分給下屬的部分，剩下歸李雙喜個人的銀子，少說也得上萬兩，他怎能不興奮！
午夜時分，李雙喜率3000騎兵抵達了距清遠門八里的一處緩坡背後，這個距離是經過精心計算的，以騎兵每小時80裡的賓士速度，半盞茶的工夫即可衝到城門下，也就是說姜瓖在清遠門的內應只需堅持半盞茶的時間即可。
這天夜間月光不錯，勉強可以視物，但闖軍的行動卻受到很大限制，原因是古代軍隊計程車兵普遍存在夜盲症，所謂夜盲症是由於蛋白質、脂肪和糖類攝取不足，導致缺乏維生素A，引起的一種在低亮度環境下無法視物的症狀。
夜盲症在明末軍隊中非常普遍，當時的普通士兵能吃飽飯就算不錯了，哪裡有肉吃，糖更是稀罕物，貞觀年間，唐太宗曾派人前往印度學習熬糖法，從此，中國就有了紅糖，但即使到明代時，紅糖依然昂貴，很多人見都沒見過。
因此，儘管這天夜裡有月光，闖軍騎兵的視力很差，又不能打火把，這就不容易辨別方向和部署人馬，因此，探馬在這一帶預先留下了標記，闖軍只要找到標記，只需順著標記走，即可到達出發位置。雖然明軍白天在這裡的哨卡都已撤走，但還得防備可能的暗哨，不能發出聲響，因此闖軍騎兵的馬蹄用布包裹，馬嘴也被包起來，約定的時間是寅時，闖軍還要在這裡等一段時間，後半夜的西北荒野非常寒冷，生火自然是不敢的，騎兵不得不用馬的體溫取暖。
其實，侯明昊派出的錦衣衛早已在不遠處高地上的龍王廟設了暗哨，精銳哨探，尤其重視目力，可不會有夜盲症，值守的錦衣衛遠遠就發現了闖軍，並用信鴿將訊息傳回了大同城，閻應元看罷立即下令伏兵進入戰備狀態。
寅時終於到了，但閻應元卻下令晚一點發訊號，因為他知道城外的闖軍後半夜在野地裡苦等，很不好受，多讓他們熬上一分，就能將他們的戰鬥力多消減一分。
終於，到了寅時三刻左右，在清遠門月城城門垛口處，一個人舉著火把開始繞圈，本來城頭上每隔一段距離都是插有火把的，以便為值守的軍士照明，因此，需要用火把繞圈的方式向遠處的闖軍發訊號。
派到前面望風的哨探迅速發現了這個情況，急忙向李雙喜報告，但闖軍仍然沒有任何動作，因而吊橋還沒有放下來，月城城門也沒有開啟，一旦提前發起衝擊，讓守軍有了警覺，再把吊橋拉上去就功虧一簣了，也就是說，只有一次突襲機會，必須牢牢把握。
約莫又過了半柱香的工夫，月城城門外護城河上的吊橋緩緩放了下來，周圍的夜色更濃了，一切都彷彿被黑暗籠罩，闖軍依然未動，但李雙喜卻摸到前面親自察看了，作為一名老流寇，他作戰經驗豐富，深知掌握第一手情報的重要性，在這個節骨眼上，他只相信自已的眼睛，又過了半盞茶的時間，月城城門終於從裡面被人開啟了。