在繁華的東京，陽光透過高樓的縫隙灑在街道上。毛利偵探事務所內，柯南、小蘭和毛利小五郎正享受著相對平靜的一天。

柯南像往常一樣在一旁靜靜地看著書，心中卻始終思考著各種案件的細節。小蘭則在整理著房間，偶爾和柯南聊上幾句。毛利小五郎則懶散地躺在沙發上，看著電視。

突然，電話鈴聲響起，毛利小五郎不耐煩地起身去接電話。電話那頭傳來了一個焦急的聲音，說是有一起奇怪的事件發生，希望毛利偵探能夠幫忙調查。毛利小五郎一聽有案件，立刻來了精神，帶著柯南和小蘭迅速趕往案發地點。

他們來到了一棟陳舊的大樓，這棟大樓看起來有些陰森。進入大樓後，一股陳舊的氣息撲面而來。他們按照指示來到了位於三樓的一間廁所前。

廁所外站著幾個神色慌張的人，其中一個人是大樓的管理員。管理員向毛利小五郎他們講述了事情的經過。原來，今天早上有清潔人員在打掃這間廁所時，發現了一些奇怪的跡象，似乎有人在這裡進行了某種秘密的活動。

毛利小五郎走進廁所，開始仔細地檢視。柯南也緊隨其後，敏銳的目光掃視著每一個角落。廁所內的佈置很簡單，幾個隔間，洗手池和一些衛生用品。

柯南注意到其中一個隔間的門有些異常，門把手上似乎有一些輕微的刮痕。他輕輕推開門，發現裡面有一些奇怪的痕跡，像是有人在這裡掙扎過。他蹲下身子，仔細觀察著地面，發現了一些細小的毛髮和一些不明液體的痕跡。

毛利小五郎則在其他地方檢視，他發現洗手池下面的水管似乎有些鬆動，好像被人動過。他叫來管理員詢問，管理員表示之前並沒有注意到這個情況。

小蘭在外面和其他證人交談，試圖從他們那裡獲取更多的資訊。

柯南在隔間內繼續探索，他在馬桶後面發現了一個小小的暗格，裡面似乎藏著什麼東西。他小心地開啟暗格，發現了一張紙條，上面寫著一些奇怪的數字和符號。

柯南皺起眉頭，思考著這些數字和符號的意義。他意識到，這可能是解開這個秘密的關鍵線索。

與此同時，毛利小五郎在外面也有了新的發現。他在廁所外面的走廊上發現了一些腳印，腳印看起來很新，應該是不久前留下的。他順著腳印追蹤，發現腳印一直延伸到了樓梯口。

柯南從隔間出來，將發現的紙條拿給毛利小五郎看。毛利小五郎看著紙條，也是一臉困惑。他們決定先回偵探事務所，仔細研究這些線索。

回到事務所後，柯南和毛利小五郎開始對線索進行分析。柯南利用他聰明的頭腦和豐富的知識，試圖解讀紙條上的數字和符號。經過一番努力，他終於發現了其中的奧秘。

原來，這些數字和符號是一種密碼，隱藏著一個重要的資訊。柯南根據密碼的提示，推斷出這個秘密可能與一件珍貴的物品有關。

而毛利小五郎則透過對腳印的分析，大致確定了嫌疑人的身高和體重範圍。

隨著調查的深入，柯南和毛利小五郎逐漸接近真相。他們開始排查與這件事有關的人員，試圖找出那個隱藏在背後的兇手。

在調查的過程中，他們遇到了各種各樣的阻礙和困難。有些人故意隱瞞資訊，有些人則試圖誤導他們的調查方向。但柯南和毛利小五郎並沒有放棄，他們憑藉著堅定的信念和敏銳的洞察力，一步步揭開了這個隱藏在廁所中的秘密。

然而，就在他們即將揭開真相的時候，意外發生了。一個神秘的人出現了，試圖搶走他們手中的關鍵線索。柯南和毛利小五郎與這個神秘人展開了一場激烈的追逐和搏鬥。

在追逐的過程中，柯南展現出了他驚人的身手和智慧，不斷地與神秘人周旋。毛利小五郎也發揮出了他的力量，與神秘人展開了正面的對抗。

經過一番激烈的戰鬥，柯南和毛利小五郎終於制服了神秘人，保住了關鍵線索。

接下來，他們繼續深入調查，終於找到了隱藏在廁所中的秘密。原來，這個秘密涉及到一個龐大的犯罪組織，他們試圖透過這個秘密來獲取巨大的利益。

柯南和毛利小五郎成功地揭露了這個犯罪組織的陰謀，將他們繩之以法。案件終於得到了解決，城市又恢復了往日的平靜。

柯南和毛利小五郎的名聲也因此更加響亮，他們繼續在偵探的道路上前行，為維護社會的和平與正義而努力。